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Le microbiote intestinal regroupe l’ensemble des micro-organismes qui peuplent notre tube digestif. Leur répartition ne se fait pas de façon homogène : la concentration en bactéries augmente tout au long du tractus digestif pour être maximale dans le côlon, alors qu’il y a très peu de bactéries dans la partie supérieure du tube digestif (œsophage, estomac). La concentration est minimale dans l’estomac, à cause de son extrême acidité peu favorable à la croissance bactérienne. On pensait même l’estomac totalement stérile jusqu’à la découverte de la bactérie Helicobacter pylori dans les années 1980, bactérie capable de survivre au milieu très acide de l’estomac. Depuis, l’idée d’un microbiote gastrique peuplant spécifiquement l’estomac a émergé dans la communauté scientifique.
Jérôme Simon « Le microbiote intestinal : un “ organe ” méconnu. » Sciences du Vivant [q-bio]. 2016. ffdumas-01758719f
La muqueuse gastrique est l’intérieur de la paroi de l’estomac. Elle est couverte d’une épaisse couche de mucus la protégeant de l’acidité ambiante, et possède son propre microbiote, formant ainsi un véritable écosystème gastrique.
La composition du microbiote varie selon sa localisation : le tractus digestif abrite ainsi des centaines d’espèces bactériennes différentes, et le microbiote présent dans l’intestin sera bien différent du microbiote présent dans l’estomac.
Schéma adapté à partir de « Le microbiote intestinal : un “ organe ” méconnu. », Jérôme Simon (2016)
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